Son cinco las décadas en que la Facultad lleva formando generaciones de alumnos desde que fue erigida canónicamente el 6 de febrero de 1967 como la primera en España después del Concilio Vaticano II. En el documento de erección se invocaba el peso de la tradición teológica española proponiendo a la nueva Facultad la tarea de preparar a sus alumnos en las modernas ciencias afines a la Teología. Están afiliados a la Facultad los seminarios mayores diocesanos de Astorga y el Burgo de Osma, y agregados el Instituto Superior de Teología de las Islas Canarias “Virgen de la Candelaria” y el Estudio Teológico Agustiniano de Valladolid. En cuanto a las áreas de gestión académica, estas se estructuran en los departamentos de Filosofía, Teología dogmática y fundamental y Teología práctica y espiritualidad.