La primera fase del proyecto consistirá en la construcción de una nueva cubierta, a falta de la colocación de la teja. La diócesis aportará 35.729, que se suman a los 53.700 ya invertidos.

Los dos relieves de la ermita, robados en 2004, se encuentran en la embajada española en Londres a la espera de tramitar su traslado a Burgos.

Junto a la declaración BIC, con categoría de Monumento, se delimita también un entorno de protección para preservar la relación del monasterio con el medio físico en que se ubica.

El Tribunal ha declarado firme la sentencia de la Audiencia Provincial de Burgos que determinaba que la titularidad es de la parroquia de San Miguel Arcángel.

Junta, Diputación, Arzobispado y Ayuntamiento de Aguilar de Bureba firman un convenio para reparar el mal estado de las cubiertas del edificio, cuyos orígenes se remontan al siglo XII.